סוג האירוע

בחר הכל

קולוקוויום

סמינרים

כנסים וימי עיון

מועדון IAP

צהרי יום א'

הרצאות לקהל הרחב

ימים פתוחים וייעוץ

טקסים ואירועים מיוחדים

תחום האירוע

בחר הכל

ביה"ס לפיזיקה ולאסטרונומיה

החוג לאסטרופיזיקה

החוג לחומר מעובה

החוג לחלקיקים

המועדון האסטרונומי

סמינר לפיזיקה של מערכות ביולוגיות וחומרים רכים: Protein-DNA binding in the absence of specific base-pair recognition

David Lukatsky, BGU

12 בנובמבר 2014, 11:10 
בניין שנקר פיזיקה, חדר 105 
סמינר לפיזיקה של מערכות ביולוגיות וחומרים רכים

abstract:

Until now, it has been reasonably assumed that specific base-pair recognition is the only mechanism controlling the specificity of transcription factor (TF)-DNA binding. Contrary to this assumption, we have shown that nonspecific DNA sequences possessing certain repeat symmetries, when present outside of specific TF binding sites (TFBSs), statistically control TF-DNA binding preferences. We used high-throughput protein-DNA binding assays to measure the binding levels and free energies of binding for several human TFs to tens of thousands of short DNA sequences with varying repeat symmetries. Based on statistical mechanics modeling, we identify a new protein-DNA binding mechanism induced by DNA sequence symmetry in the absence of specific base-pair recognition, and experimentally demonstrate that this mechanism indeed governs protein-DNA binding preferences.

References: Ariel Afek, Joshua L. Schipper, John Horton, Raluca Gordân, and David B. Lukatsky, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, doi: 10.1073/pnas.1410569111, (Early Edition, Oct 13) (2014) http://www.pnas.org/content/early/2014/10/08/1410569111.

 

מארגן הסמינר: גיא יעקובי

אוניברסיטת תל אביב עושה כל מאמץ לכבד זכויות יוצרים. אם בבעלותך זכויות יוצרים בתכנים שנמצאים פה ו/או השימוש שנעשה בתכנים אלה לדעתך מפר זכויות, נא לפנות בהקדם לכתובת שכאן >>
אוניברסיטת תל-אביב, ת.ד. 39040, תל-אביב 6997801
UI/UX Basch_Interactive